洪天琪, 杨笑亚, 张慧燕, 葛凯莉, 薛洋洋, 魏春山. 基于数据挖掘和网络药理学探析肝癌的用药规律及作用机制. 2024. biomedRxiv.202407.00040
基于数据挖掘和网络药理学探析肝癌的用药规律及作用机制
通讯作者: 魏春山, wcs66@qq.com
DOI:10.12201/bmr.202407.00040
Exploring medication rules and mechanism for liver cancer based on data mining and network pharmacology
Corresponding author: Wei Chunshan, wcs66@qq.com
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摘要:目的/意义 通过数据挖掘和网络药理学探析国家专利治疗肝癌的用药规律及核心药对机制。方法/过程 建立肝癌复方专利数据库,采用Excel、IBM SPSS Modeler、Cytoscape、Origin、Rstudio进行频数、功效、性味归经、聚类及关联规则分析挖掘用药规律和核心药对。利用TCMSP、OMIM、GeneCards数据库收集药物有效活性成分及靶点和疾病靶点,STRING数据库收集交集靶点、关键靶点和蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,微生信平台和分子对接法进行富集分析及预测有效活性成分和关键基因的结合性能。结果/结论 国家复方专利治疗肝癌重在肝脾并调以扶其正,解毒抑癌、活血化瘀以化其实。黄芪、半枝莲可能通过多成分、多靶点、多途径治疗肝癌。
Abstract: Purpose/Significance To explore the drug rules and core drug mechanism of national patents for the treatment of liver cancer through data mining and network pharmacology. Method/Process Establish a database of liver cancer compound patents. Excel, IBM SPSS Modeler, Cytoscape, Origin, and Rstudio were used to analyze frequency, efficacy, taste, clustering, and association rules for exploring drug rules and core drug pairs. TCMSP, OMIM, and GeneCards databases were used to collect effective active ingredients, targets, and disease targets, and STRING databases were used to collect intersecting targets, key targets, and PPI network diagrams. Analyze the enrichment of GO and KEGG and predict the binding performance of effective active ingredients and key genes by micro-bio-informatics platform and molecular docking method. Result/Conclusion The national compound patent for the treatment of liver cancer focuses on the simultaneous regulation of the liver and spleen, detoxification and inhibition of cancer, blood circulation and blood stasis. Astragalus and Scutellaria barbata may treat liver cancer through multi-component, multi-target, and multi-pathway.
Key words: Hepatocarcinoma; data mining; Astragalus; Scutellaria barbata; network pharmacology; molecular docking提交时间:2024-07-17
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序号 提交日期 编号 操作 1 2024-04-01 bmr.202407.00040V1
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